Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn2Q99KJ8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dctn2Q99KJ8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms