Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp11Q99K46 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms