Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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