Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kdelr1Q99JH8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdelr1Q99JH8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms