Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec3Q99J72 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms