Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms