Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms