Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Synpo2Q91YE8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Synpo2Q91YE8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms