Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms