Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac11Q91WA3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms