Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NifkQ91VE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NifkQ91VE6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms