Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms