Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd49Q8VE42 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms