Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmx1Q8VBT0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmx1Q8VBT0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms