Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc9a8Q8R4D1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a8Q8R4D1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms