Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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