Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdc16Q8R349 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cdc16Q8R349 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdc16Q8R349 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms