Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg10Q8R1P4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg10Q8R1P4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms