Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc12Q8K5B8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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