Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitrm1Q8K411 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms