Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms