Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vrk3Q8K3G5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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