Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms