Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms