Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znf628Q8CJ78 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Znf628Q8CJ78 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf628Q8CJ78 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Znf628Q8CJ78 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Znf628Q8CJ78 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf628Q8CJ78 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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