Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms