Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc8Q8CFD5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc8Q8CFD5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ercc8Q8CFD5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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