Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp27Q8CEG8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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