Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8CD60 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8CD60 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8CD60 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8CD60 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8CD60 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8CD60 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms