Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms