Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssuh2Q8C3L1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms