Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C1R3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C1R3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C1R3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms