Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVT6

Pp2d1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pp2d1Q8BVT6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pp2d1Q8BVT6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pp2d1Q8BVT6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms