Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pggt1bQ8BUY9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pggt1bQ8BUY9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pggt1bQ8BUY9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pggt1bQ8BUY9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pggt1bQ8BUY9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms