Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Suds3Q8BR65 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms