Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DseQ8BLI4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DseQ8BLI4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms