Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc2Q8BKV1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms