Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc9Q8BJN4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms