Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prox2Q8BII1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms