Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ubash3bQ8BGG7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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