Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms