Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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