Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms