Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tnfsf18Q7TS55 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms