Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed3Q78IS1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms