Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms