Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Topbp1Q6ZQF0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms