Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NinlQ6ZQ12 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms