Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms