Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rhox8Q6VSS7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rhox8Q6VSS7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms